MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 27406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_019942	GA	4	8	1417500	1417507	50 %	0 %	50 %	0 %	432329434
27003	NC_019942	A	6	6	1417546	1417551	100 %	0 %	0 %	0 %	432329434
27004	NC_019942	AGA	2	6	1417567	1417572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329434
27005	NC_019942	CTT	2	6	1417644	1417649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329434
27006	NC_019942	AG	3	6	1417708	1417713	50 %	0 %	50 %	0 %	432329434
27007	NC_019942	GAA	2	6	1417817	1417822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329434
27008	NC_019942	CTGC	2	8	1417906	1417913	0 %	25 %	25 %	50 %	432329434
27009	NC_019942	TC	3	6	1417937	1417942	0 %	50 %	0 %	50 %	432329434
27010	NC_019942	AAT	2	6	1417958	1417963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329434
27011	NC_019942	ACA	2	6	1417992	1417997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329434
27012	NC_019942	CCA	2	6	1418080	1418085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329434
27013	NC_019942	GAG	2	6	1418109	1418114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329434
27014	NC_019942	AGG	2	6	1418118	1418123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329434
27015	NC_019942	TCA	2	6	1418185	1418190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329434
27016	NC_019942	GCC	2	6	1418193	1418198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329434
27017	NC_019942	AG	3	6	1418234	1418239	50 %	0 %	50 %	0 %	432329434
27018	NC_019942	GATA	2	8	1418295	1418302	50 %	25 %	25 %	0 %	432329434
27019	NC_019942	AT	3	6	1418358	1418363	50 %	50 %	0 %	0 %	432329434
27020	NC_019942	ACT	2	6	1418365	1418370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329434
27021	NC_019942	A	6	6	1418418	1418423	100 %	0 %	0 %	0 %	432329435
27022	NC_019942	GCA	2	6	1418470	1418475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329435
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27029	NC_019942	TTA	2	6	1418864	1418869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329436
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27032	NC_019942	TAA	2	6	1419012	1419017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329436
27033	NC_019942	TCG	2	6	1419030	1419035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329436
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27035	NC_019942	TACCC	2	10	1419069	1419078	20 %	20 %	0 %	60 %	432329436
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27037	NC_019942	ATCT	2	8	1419153	1419160	25 %	50 %	0 %	25 %	432329436
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27039	NC_019942	ATG	2	6	1419203	1419208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329436
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27043	NC_019942	AAG	2	6	1419344	1419349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329436
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27049	NC_019942	TC	3	6	1419607	1419612	0 %	50 %	0 %	50 %	432329436
27050	NC_019942	AAGACC	2	12	1419731	1419742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	432329436
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27052	NC_019942	TGC	2	6	1419865	1419870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329436
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27055	NC_019942	GTT	2	6	1420186	1420191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329437
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27090	NC_019942	ATA	2	6	1421939	1421944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329439
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27105	NC_019942	CAT	2	6	1422507	1422512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329440
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27113	NC_019942	GAAAT	2	10	1422918	1422927	60 %	20 %	20 %	0 %	432329441
27114	NC_019942	TAA	2	6	1422985	1422990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329441
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27118	NC_019942	AT	3	6	1423256	1423261	50 %	50 %	0 %	0 %	432329441
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27124	NC_019942	GGTT	2	8	1423672	1423679	0 %	50 %	50 %	0 %	432329441
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27131	NC_019942	C	6	6	1424244	1424249	0 %	0 %	0 %	100 %	432329442
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27230	NC_019942	CT	3	6	1429034	1429039	0 %	50 %	0 %	50 %	432329447
27231	NC_019942	CTG	2	6	1429092	1429097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329447
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.